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科研進展

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實時單細胞多模態原位檢測miRNA《Applied materials & Interface》

發布時間:2024-07-24 作者:江蘇瑞明生物科技有限公司 點擊次數:377次

內容概要:
概述

湖北大學王升富、文為教授課題組在《Applied Materials & Interface》期刊發表最新研究成果:“Endogenous Protease-Activatable Nanosensor Based on PNA?Peptide?DNA Engineering for AND-Gated and Dual-Model Detection of MicroRNA in Single Living Tumor Cells ” ,研究組提出了一種由肽核酸-肽- DNA共聚物引導的內源性蛋白酶激活納米傳感器(PA-NS),代替外源性引發劑在體外原位檢測低含量的癌癥生物標志物,通過實時單細胞多模態分析技術,結合電化學檢測和光學成像研究PA-NS在活腫瘤細胞中對miRNA-21 (miR-21)的光電雙模型檢測。

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圖1.雙模態響應的PA-NS在單個活腫瘤細胞中腫瘤特異性檢測miR-21的示意圖


            
研究背景
            

腫瘤生長和轉移是全球癌癥死亡的主要原因。腫瘤微環境的相互作用可以積極或消極地調節腫瘤的生存、增殖和進展,因此,開發快速、靈敏的分析方法來檢測腫瘤內的疾病標志物是至關重要的,特別是組織蛋白酶B (CaB)是溶酶體中發現的一種內源性酶,在多種腫瘤細胞中發現蛋白酶的表達水平異常上調,能促進腫瘤血管的增殖,增強腫瘤細胞的運作能力。此外,微核糖核酸(miRNAs)是一類小的內源性非蛋白編碼RNA,普遍參與基因表達和多種生物過程的調控,包括細胞分化和凋亡。miRNA的表達水平和亞細胞分布與腫瘤細胞的生長分化密切相關。因此,CaB蛋白酶和miRNA這兩種促轉移性生物分子的生長和表達,不僅可以讓人們了解它們的生理和病理作用,而且可以為腫瘤相關轉移和進一步診斷提供見解。考慮到實體腫瘤微環境中內在刺激的廣泛分布,許多納米探針已經被提出用于敏感檢測miRNA或CaB蛋白酶,這些探針大多具有“永遠開啟”的輔助觸發器,具有“隨時開啟”和“隨時開啟”的響應特征,沒有理想的時空選擇性或腫瘤特異性活性。這可能阻礙用于癌細胞原位監測和成像治療的某些組件的應用,并導致治療不足或過度治療。
研究組提出了一種由肽核酸-肽- DNA共聚物引導的內源性蛋白酶激活納米傳感器(PA-NS),代替外源性引發劑在體外原位檢測低含量的癌癥生物標志物,通過瑞明生物實時單細胞多模態分析技術結合電化學檢測和光學成像在活腫瘤細胞中實現對miRNA-21 (miR-21)的光電雙模型傳感,而無需額外引入外源性激活劑或納米材料。同時,PA-NS只能同時被“雙鑰匙”(腫瘤細胞中過表達的miR-21和組織蛋白酶B蛋白酶)激活,從而有效提高PA-NS腫瘤細胞特異性。在單個腫瘤細胞中測量的熒光強度比單個健康細胞高 ~3.5倍,并且在靶miRNA存在下電化學響應降低了~30%。該研究保證了出色的腫瘤選擇性,為研究細胞異質性提供了新的機會,為低至單細胞水平的癌癥診斷和治療提供了更可靠的基礎。

            
要點解析
            

要點1 PA-NS對miR-21體外光學傳感的評價

為了在體外研究CaB特異性PA-NS的傳感活性,研究組監測了在添加或不添加CaB的情況下,miR-21濃度升高時FAM熒光信號的恢復情況。研究結果標明,在沒有CaB的情況下,隨著miR-21濃度的增加,PA-NS的熒光增加不明顯,這表明在沒有CaB的情況下,PA-NS的傳感活性被鎖定。而經過CaB預處理后,隨著miR-21濃度的增加,熒光明顯增加,這表明PA-NS的檢測活性可以被CaB“按需”激活。進一步研究將PA-NS與CaB和miR-21單獨或聯合孵育,結果表明PA-NS的熒光受到CaB和miR-21的共同控制。如圖2c所示,PA-NS分別與CaB或miR-21孵育后,觀察到幾乎可以忽略不計的熒光響應。相比之下,只有當PA-NS與CaB和miR-21聯合孵育時才出現明顯的熒光增強,這表明成功制作了門控傳感平臺(圖2d)。

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2.(a) PA-NS雙模態檢測miR-21示意圖。(b)CaB激活或未激活的情況下,PA-NS對不同濃度miR-21反應的熒光強度。(c) PA-NSmiR-21CaB單獨或聯合孵育的熒光強度。(d) PA-NS檢測miR-21的邏輯運算真值表(添加和不添加miR-21CaB分別定義為“1”“0”)(e)不同濃度的PA-NS電化學檢測miR-21I?V特性(插圖為I?log C的校準曲線)


要點2單細胞水平上研究PANS探針的腫瘤特異性活性

研究組以腫瘤細胞為實驗組,健康細胞為對照組。如圖3b所示,利用CaB蛋白酶在腫瘤細胞中選擇性激活PA-NS系統,隨后通過與miR-21的位移反應誘導FAM熒光團的釋放。如圖3c所示,監測到活化的PA-NS探針在活腫瘤細胞中有明顯的FAM熒光響應;PA-NS探針的成功激活可歸因于腫瘤細胞中CaB蛋白酶的過表達,HeLa細胞中miR-21的高水平進一步觸發位移反應。相比之下,由于CaB蛋白酶的低表達,PA-NS探針在健康細胞中被“鎖定”(圖3d),表明PA-NS探針在健康細胞中不能被激活。如圖3e所示,PA-NS釋放的FAM的熒光響應幾乎可以忽略不計,這表明PA-NS具有優異的腫瘤特異性活性,在臨床癌癥診斷和治療方面可能具有相當大的應用潛力。
      隨后,用微光纖(~ 10 μm)收集單個活腫瘤和健康細胞的熒光信號,進一步證明了腫瘤特異性活性。首先,將PA-NS轉染到腫瘤細胞中,再孵育3.5 h,激活探針并釋放FAM熒光信號。然后,利用三軸微操作系統將微光纖精確地附著在細胞膜上。在微光纖的輔助下,將495nm的激發光引導至單個活細胞,激活FAM熒光信號。如圖3f所示,微光纖輻照后細胞形態和細胞活力幾乎不受影響,說明微光纖對細胞活性的影響可以忽略不計。然后用光電倍增管(PMT)收集并記錄單個活細胞的熒光信號。利用微光纖分別監測單個腫瘤細胞和健康細胞釋放的FAM信號。如圖3g所示,通過PMT獲取6個單個腫瘤細胞和健康細胞釋放的FAM熒光信號,并用微光纖進行定量分析。我們看到腫瘤細胞釋放的熒光強度遠高于健康細胞,證實PA-NS在腫瘤細胞中可以被特異性激活,在健康細胞中處于“停止”狀態。考慮到細胞的異質性,從20個單個活腫瘤細胞和健康細胞中收集相應的統計結果,揭示了熒光強度的變化。如圖3h所示,在單細胞水平上,腫瘤細胞的熒光強度值比健康細胞高約3.4倍,比空白組高約5.1倍,這與熒光成像結果吻合良好。此外,健康細胞的熒光強度比空白組高~ 1.55倍,表明PA-NS具有令人滿意的腫瘤特異性活性和對腫瘤細胞的低背景信號。

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3.(a)Lip3000轉染PA-NS的過程。(b) PA-NS在腫瘤細胞中的活化過程。(d) PA-NS在健康細胞中的反應。高分辨率熒光顯微鏡圖像顯示PA-NS對腫瘤細胞(HeLa細胞)(c)和健康細胞(HUVEC細胞)(e)的反應。(f)高分辨率熒光顯微鏡圖像顯示靠近細胞的微光纖:(i)無激發的亮場;(ii)在約490 nm處激發;(iii)與赫斯特病毒孵育;()合并圖像。(g)利用微光纖檢測PA-NS在單個活腫瘤細胞和健康細胞中的熒光響應。(h)利用微光纖,PA-NS對單個活腫瘤細胞和健康細胞的對應熒光強度(490nm)箱形圖。標尺:20 μm

要點3 miR-21在單個活細胞中的原位光學定性和電化學定量分析

為了驗證在單個活細胞中同時進行光學和電化學檢測miR-21的可行性,首先,評估了用電極插入細胞并同時用微光纖將其連接到同一細胞上的操作可行性。如圖4a所示,在雙邊三軸微操作系統的幫助下,納米電極和微光纖被引導并移動到同一個單細胞中。用微光纖監測了單個腫瘤細胞60s內熒光強度的變化。如圖4b所示,觀察到一個“signal-on”熒光信號,熒光強度在60s內趨于穩定,說明FAM熒光信號具有良好的穩定性和低背景信號。考慮到細胞的異質性,收集并測量了幾種腫瘤細胞的熒光強度。如圖4c所示,腫瘤細胞的熒光響應比空白組高~ 5倍,證明PA-NS可以在腫瘤細胞中被激活,并借助微光纖實現單細胞水平的光學分析。接下來,評估了用修飾的Au NE在單個活細胞中電化學檢測miR-21的可行性。如圖4d所示,通過三軸微操作系統控制和引導修飾后的Au NE附著在細胞上,然后通過倒置顯微鏡上安裝的微操作器調節納米電極并插入細胞(圖4e)。考慮到細胞的異質性,對15個單個活腫瘤細胞收集并分析相應的統計結果。如圖4f所示,納米電極與腫瘤細胞孵育后,電化學信號下降了約40% (***P < 0.001;平均值±SD = 1.00±0.09 vs 0.62±0.09),表明PA-NS涉及雙模型信號輸出平臺,可以檢測單個活腫瘤細胞中的miR-21。

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圖4.(a)顯示插入單細胞的納米電極和用于單細胞光子數收集的光源引導的微光纖的顯微圖像。(b)微光纖采集的腫瘤細胞熒光強度。(c)使用微光纖對單個腫瘤細胞的熒光強度進行相應的直方圖統計。納米電極在細胞外(d)和插入細胞內(e)。(f) 15個單個活腫瘤細胞對應的電流框圖。標尺:20 μm。

技術簡介
            
單細胞分析技術因具有理想的時空分辨率以監測細胞成分已經獲得了大量的關注。單細胞分析旨在闡明細胞的異質性和細胞信號轉導的動力學,而不是群體平均,以幫助準確的病理檢查,特別是一些與癌癥的早期診斷和治療密切相關低含量的物質,如miRNA。此外,在單個活細胞中原位分析miR-21不僅可以提供miR-21在細胞不同部位分布的精確信息,還可以研究其在癌癥發展中的增殖和轉移。細胞成分的電化學分析依賴于特定的微創納米設備,這些設備可以在不破壞細胞活力的情況下進入細胞內環境,從而能夠在單個活細胞的理想位置進行原位定量分析,甚至可以從單個細胞中提取特定結構(例如,細胞核,線粒體,溶酶體)。然而,電化學傳感器的選擇性和通用性仍然不足。與電化學分析相比,光學檢測在微/納米光纖的輔助下,通過熒光成像和單個活細胞的原位熒光分析,可以同時對多種細胞成分進行定性分析,具有高通量和直觀觀察的優點。然而,熒光探針可能的光漂白、低組織滲透活性和有限的空間定位能力可能會阻礙其在細胞水平上持續穩定分析的應用。因此,設計一種具有光學和電化學響應的互補納米探針,同時對單個活細胞進行原位定量和定性分析是必要的。此外,雙信號讀出也可以有效地減少假陽性和假陰性結果,進一步提高測量精度。

實時單細胞多模態分析儀 

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瑞明生物實時單細胞多模態分析儀主要性能

1、實時單細胞多指標檢測:實時檢測單個活細胞內小分子含量(如葡萄糖、乳酸、ATP、膽固醇、Ca2+、K+等)及酶活性(葡萄糖苷酶、鞘磷脂酶、乳酸脫氫酶等),可匹配160余種商品化試劑盒;

2、實時亞細胞原位檢測:在亞細胞水平(胞質、胞核、胞膜)實現實時連續、原位檢測;

3、超微量提取、注射:單細胞水平提取細胞器(如溶酶體、線粒體)、胞質進行質譜或其它平臺的聯用分析;單細胞注射藥物、代謝劑等,并進行藥效或機制評價;

4、活體水平檢測:活體水平實時檢測生化指標(用藥前后、中醫藥針灸刺激前后)的變化。

文獻詳情

Endogenous Protease-Activatable Nanosensor Based on PNA–Peptide–DNA Engineering for AND-Gated and Dual-Model Detection of MicroRNA in Single Living Tumor Cells

Xiaoxue Xi, Zhen Wu, Xiuhua Zhang, Yuebin Li, Yuandi Zhao, Wei Wen, and Shengfu Wang

ACS Applied Materials & Interfaces 2023 15 (18), 21917-21928

DOI: 10.1021/acsami.3c02012


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